Ο κύριος σκοπός της ανίχνευσης αντιγόνου Chlamydia trachomatis είναι να διαπιστωθεί εάν υπάρχει λοίμωξη από Chlamydia trachomatis. Εάν το αποτέλεσμα της εξέτασης είναι θετικό, σημαίνει ότι έχει μολυνθεί το Chlamydia trachomatis. Το μόνο μολυσμένο κύτταρο Chlamydia trachomatis στο ανθρώπινο σώμα είναι το κύτταρο του επιπεφυκότα του ανθρώπινου ματιού, το οποίο θα οδηγήσει στην παραγωγή τραχώματος, δηλαδή ενός είδους χρόνιας επιπεφυκίτιδας.